Guía de Usuario

En este espacio encontrará una colección de scripts de ejemplo diseñados específicamente para ejecutarse en el clúster Yuca. Estos archivos pueden servir como referencia o punto de partida para la configuración y ejecución de sus propios proyectos de cómputo.

 

Instrucciones de Uso

1. Copia de archivos
Antes de ejecutar cualquiera de los scripts, es necesario copiar los archivos a su directorio personal.

2. Ejecución
Una vez copiados los archivos, podrá ejecutarlos desde su directorio personal utilizando el comando sbatch, o el que corresponda según el entorno o aplicación.

3. Notas importantes

  • Si se intenta ejecutar un script directamente desde este directorio, el sistema puede mostrar que el comando fue aceptado, pero no se procesará ni se generarán archivos de salida.

  • Los ejemplos de PyTorch, GROMACS y Quantum ESPRESSO requieren pasos previos específicos, los cuales están descritos en los archivos .sh correspondientes para su envío mediante SLURM.

  • Los ejemplos de PyTorch y base_gpu hacen uso de GPU; los demás están configurados para CPU.

    Las GPUs del clúster son AMD. Para que frameworks como PyTorch o TensorFlow reconozcan correctamente estas GPU, debe instalarse la versión correspondiente con soporte para ROCm.
    Ejemplo para PyTorch:

    bash

    • pip install torch torchvision torchaudio --index-url https://download.pytorch.org/whl/rocm6.3

  • Los ejemplos de GROMACS y Quantum ESPRESSO no generan archivos estándar slurm-<jobid>.out, ya que redirigen la salida a los archivos job_output.txt y job_error.txt. Esta es una práctica opcional y configurable.

 

Scripts de ejemplos

Nota importante : Cada enlace dirige a un archivo comprimido, el cual debe descargarse, descomprimirse y colocarse en el directorio home del usuario para su uso.